Jérémie Rispal Élucider les rapports entre microbiote et épigénétique pour comprendre les maladies inflammatoires chroniques de l’intestin

Du microbiote à l'épigénétique

Le microbiote regroupe les microorganismes présents dans notre intestin. Il a de multiples fonctions dans la santé et la maladie. En particulier, ces microorganismes peuvent modifier l'identité des cellules de l'intestin en régulant l'expression des gènes de ces cellules, de façon épigénétique. Pour ce faire, ils pourraient agir sur les protéines qui guident le repliement et l'organisation de l'ADN dans le noyau des cellules, rendant différentes régions de celui-ci plus ou moins disponibles à la lecture.

Jérémie Rispal propose d'étudier les changements que le microbiote produit sur l’expression des gènes des cellules de l'intestin, et leur impact sur l'apparition de maladies inflammatoires chroniques de l'intestin.

Régulation transcriptionnelle et maladies inflammatoires chroniques de l'intestin

Dans le laboratoire d'Ophir Klein à l'Université de Californie San Francisco, Jérémie Rispal observera les changements dans l'organisation de l'ADN et ses conséquences sur la lecture des gènes dans l'intestin sain et malade, et en l'absence ou en présence de microbiote. Cela lui permettra de connaître la contribution du microbiote dans la régulation épigénétique des cellules de l'intestin.

Pour savoir si les changements épigénétiques observés sont la cause de l’effet du microbiote sur les maladies inflammatoires, Jérémie Rispal supprimera certaines des protéines qui remodèlent l'organisation de l'ADN dans les cellules de l'intestin, et observera si cela empêche l'apparition de ces pathologies.

Ces protéines pourraient être de bons candidats à cibler pour le traitement de ces maladies chroniques et permettre aux patients de retrouver une qualité de vie satisfaisante.